古树作为活体文物，属于国家生态战略体系的重要组成部分，古树的系统保护方案里每一个独立保护环节都需要特别慎重的科学操作。“一树一方案、一树一档案”是古树保护的基本原则，每一个方案都需要现场实地考察和科学论证才可以有的放矢，由于古树的特殊性，每一株古树所处的立地环境和树体状况都不一样，所以每一株古树的修复方案、复壮方案、消杀方案、防腐固化方案、支撑方案、养护方案、建立缓释区方案都需要对症开展，只有这样才可以让每一株古树得到科学的保护。
方案的起草和完成均需要古树专家严格的审查和批注，需要7位以上（教授级高工）古树专家，同时现场参与的专家现场论证会后出具的论证报告，只有这样才可以最大限度的保障古树学术的权威性和科学性，同时奇数的专家人数论证会可以最大限度的防止学术造假和学术乌龙的情况发生，每株古树都有自身问题的专属性，所以需要“对症下药”，实事求是的面对古树自身的问题是古树方案起草者必须坚持的职业道德，因为方案是后续执行者唯一的科学依据，具有极大的权威性，要高度严谨。严肃对待古树的每一个问题是古树保护理论阶段的基本原则，是任何情况下都不能退缩的底线。
有了科学的保护方案就相当于有正确的指导方针，明确了方向一切工作都会朝着正确的目标前进，古树保护工作初期方案的定制就是古树保护系统工作的方向和旗帜，尊重科学是最好的古树保护原则，一切保护工作的开展都要建立在严谨的科学基础上，古树保护方案是系列科学保护措施的排头兵，领头的如果站歪了，后面再怎么努力都是没有意义的事情。